Muzeum Ziemi Kociewskiej prowadzi następujące rejestry, ewidencje oraz archiwa:

·         Księgi inwentarzowe.
·         Rejestr pism wychodzących i przychodzących.
·         Ewidencje i rejestry określone w Kodeksie pracy.
·         Ewidencję wyjazdów służbowych.
·         Rejestr zarządzeń wewnętrznych.
·         Rejestr umów.
·         Rejestr zamówień publicznych.
·         Rejestr skarg i wniosków.
·         Rejestr faktur.
·         Ewidencję druków ścisłego zarachowania.
·         Rejestr czynności przetwarzania danych osobowych prowadzony na podstawie art. 30 ust. 1 RODO oraz Rejestr wszystkich kategorii czynności przetwarzania dokonywanych w imieniu administratora prowadzony na podstawie art. 30 ust. 2 RODO.
Muzeum prowadzi archiwum zakładowe.